實驗方法：實驗小組在報紙上刊登廣告并寄出許多廣告信，招募參與者前來耶魯大學協助實驗。實驗地點選在大學的老舊校區中的一間地下室，地下室有兩個以墻壁隔開的房間。廣告上說明實驗將進行約一小時，報酬是$4.50美元(大約為2006年的$20美元)。參與者年齡從20歲至50歲不等，包含各種教育背景，從小學畢業至博士學位都有。
參與者被告知這是一項關于"體罰對于學習行為的效用"的實驗，并被告知自身將扮演"老師"的角色，以教導隔壁房間的另一位參與者——"學生"，然而學生事實上是由實驗人員所假冒的。
這個實驗的目的，是為了測試受測者，在遭遇權威者下達違背良心的命令時，人性所能發揮的拒絕力量到底有多少。 實驗開始于1961年7月，也就是納粹黨徒阿道夫·艾希曼被抓回耶路撒冷審判，被判死刑后的一年。
參與者將被告知，他被隨機挑選為擔任"老師"，并獲得了一張"答案卷"。實驗小組并向他說明隔壁被挑選為"學生"的參與者也拿到了一張"題目卷"。但事實上兩張紙都是"答案卷"，而所有真正的參與者都是"老師"。"老師"和"學生"分處不同房間，他們不能看到對方，但能隔著墻壁以聲音互相溝通。有一位參與者甚至被事先告知隔壁參與者患有心臟疾病。
"老師"被給予一具據稱從45伏特起跳的電擊控制器，控制器連結至一具發電機，并被告知這具控制器能使隔壁的"學生"受到電擊。"老師"所取得的答案卷上列出了一些搭配好的單字，而"老師"的任務便是教導隔壁的"學生"。老師會逐一朗讀這些單字配對給學生聽，朗讀完畢后老師會開始考試，每個單字配對會念出四個單字選項讓學生作答，學生會按下按鈕以指出正確答案。如果學生答對了，老師會繼續測驗其他單字。如果學生答錯了，老師會對學生施以電擊，每逢作答錯誤，電擊的伏特數也會隨之提升。
參與者將相信，學生每次作答錯誤會真的遭到電擊，但事實上并沒有電擊產生。在隔壁房間里，由實驗人員所假冒的學生打開錄音機，錄音機會搭配著發電機的動作而播放預先錄制的尖叫聲，隨著電擊伏特數提升也會有更為驚人的尖叫聲。當伏特數提升到一定程度后，假冒的學生會開始敲打墻壁，而在敲打墻壁數次后則會開始抱怨他患有心臟疾病。接下來當伏特數繼續提升一定程度后，學生將會突然保持沉默，停止作答、并停止尖叫和其他反應。 電壓 "學生"的反應 75 V 嘟囔 120 V 痛叫 150 V 說，他想退出試驗 200 V 大叫："血管里的血都凍住了。" 300 V 拒絕回答問題 超過 330 V 靜默 到這時許多參與者都表現出希望暫停實驗以檢查學生的狀況。許多參與者在到達135伏特時暫停，并質疑這次實驗的目的。一些人在獲得了他們無須承擔任何責任的保證后繼續測驗。一些人則在聽到學生尖叫聲時有點緊張地笑了出來。
若是參與者表示想要停止實驗時，實驗人員會依以下順序這樣子回復他： 請繼續。 這個實驗需要你繼續進行，請繼續。 你繼續進行是必要的。 你沒有選擇，你必須繼續。 如果經過四次回復的慫恿后，參與者仍然希望停止，那實驗便會停止。否則，實驗將繼續進行，直到參與者施加的懲罰電流提升至最大的450伏特并持續三次后，實驗才會停止。
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