《生物信息學(xué)》考試大綱
一、 基本要求
掌握生物信息學(xué)常用數(shù)據(jù)庫(kù)和使用方法；掌握序列比對(duì)方法和主要比對(duì)軟件使用方法；掌握DNA序列和蛋白質(zhì)序列特征分析和常用序列分析軟件包使用方法；掌握分子進(jìn)化理論和常用分析方法；掌握基因功能注釋方法和常用軟件使用方法；掌握基因表達(dá)數(shù)據(jù)分析方法和常用分析軟件使用方法。
二、 考試范圍
1. 課程相關(guān)知識(shí)
基本要求：掌握生物信息學(xué)的定義、基本概念和發(fā)展；掌握生物信息學(xué)研究的基本內(nèi)容、基本原理和生物學(xué)基礎(chǔ)；了解計(jì)算機(jī)在生物研究中的應(yīng)用；了解生物信息學(xué)發(fā)展史、開(kāi)發(fā)與產(chǎn)業(yè)化。
1．生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)
（1）知識(shí)點(diǎn)1：NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)的介紹
（2）知識(shí)點(diǎn)2：Swiss-Prot數(shù)據(jù)庫(kù)
（3）知識(shí)點(diǎn)3：PDB數(shù)據(jù)庫(kù)
基本要求： 掌握NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)的建設(shè)和使用方法；掌握Swiss-Prot和PDB數(shù)據(jù)庫(kù)的使用方法。
2.序列比對(duì)
（1）知識(shí)點(diǎn)1：雙重序列比對(duì)分析
（2）知識(shí)點(diǎn)2：多序列比對(duì)分析
（3）知識(shí)點(diǎn)3：BLAST數(shù)據(jù)庫(kù)搜索
基本要求：掌握序列比對(duì)的原理和方法；掌握如何使用BLAST軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)庫(kù)搜索和同源性分析。
3.序列特征分析
（1）知識(shí)點(diǎn)1：DNA序列特征分析
（2）知識(shí)點(diǎn)2：蛋白質(zhì)序列特征分析
基本要求：掌握基因預(yù)測(cè)的原理和方法；掌握啟動(dòng)子區(qū)域預(yù)測(cè)和分析的原理和方法；掌握蛋白質(zhì)序列跨膜區(qū)分析的原理和方法。
4.分子進(jìn)化分析
（1）知識(shí)點(diǎn)1：系統(tǒng)發(fā)育樹的概念
（2）知識(shí)點(diǎn)2：分子進(jìn)化理論
（3）知識(shí)點(diǎn)3：系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建
基本要求：掌握系統(tǒng)發(fā)育樹的概念；掌握DNA和蛋白質(zhì)序列適應(yīng)性進(jìn)化的分子理論；掌握系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建的原理和方法。
5. 基因功能注釋
（1）知識(shí)點(diǎn)1：基因功能的基本概念
（2）知識(shí)點(diǎn)2：基因功能的注釋原理和方法
基本要求：掌握基因注釋和功能分類的基本概念；掌握基因功能注釋的原理和方法；掌握常用基因功能注釋軟件的使用；
6.基因表達(dá)數(shù)據(jù)分析
（1）知識(shí)點(diǎn)1：基因表達(dá)數(shù)據(jù)獲取的生物學(xué)技術(shù)平臺(tái)
（2）知識(shí)點(diǎn)2：基因表達(dá)數(shù)據(jù)分析
基本要求：掌握基因表達(dá)技術(shù)的主要生物學(xué)平臺(tái)；掌握基因表達(dá)數(shù)據(jù)的主要分析方法和原理；掌握基因表達(dá)數(shù)據(jù)分析常用軟件的使用。
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